caffe提供了将图像转换为lmdb或者leveldb格式的工具,在tool文件夹下的convert_imageset中可以找到对应文件,这个工具在很多例子中都有用到,比如mnist和imagenet,由于caffe默认使用lmdb这种又快又小的格式,我们在处理大量图像时也会用到,而我们如果要根据自身需求进行修改,那就需要读源码了。
这里忍不住扯一些别的,convert_imageset工具不支持浮点数和多标签,而博主的label都是浮点数和多标签,前两天准备全部使用hdf5来存储data和label,后来发现图片存储成hdf5是一件耗时费力占空间的事,于是考虑将标签存储为hdf5,而对UINT8类型的图像使用lmdb进行存储,要存成lmdb自然就会想到使用自带的工具,于是就来分析这个工具了。
我们从convert_imageset第一行开始,细细的读:
#include <algorithm> #include <fstream> // NOLINT(readability/streams) #include <string> #include <utility> #include <vector> #include "boost/scoped_ptr.hpp" #include "gflags/gflags.h" #include "glog/logging.h" #include "caffe/proto/caffe.pb.h" #include "caffe/util/db.hpp" #include "caffe/util/format.hpp" #include "caffe/util/io.hpp" #include "caffe/util/rng.hpp" using namespace caffe; // NOLINT(build/namespaces) using std::pair; using boost::scoped_ptr;
上面是文件的声明部分,caffe的工具和caffe一样穿插着glog、gflags等等库,不得不承认google的库确实非常好用,在读caffe源码前请务必了解这几个库,顺带加上protobuf:
DEFINE_bool(gray, false,
"When this option is on, treat images as grayscale ones");
DEFINE_bool(shuffle, false,
"Randomly shuffle the order of images and their labels");
DEFINE_string(backend, "lmdb",
"The backend {lmdb, leveldb} for storing the result");
DEFINE_int32(resize_width, 0, "Width images are resized to");
DEFINE_int32(resize_height, 0, "Height images are resized to");
DEFINE_bool(check_size, false,
"When this option is on, check that all the datum have the same size");
DEFINE_bool(encoded, false,
"When this option is on, the encoded image will be save in datum");
DEFINE_string(encode_type, "",
"Optional: What type should we encode the image as ('png','jpg',...).");
int main(int argc, char** argv) {
#ifdef USE_OPENCV
::google::InitGoogleLogging(argv[0]);
// Print output to stderr (while still logging)
FLAGS_alsologtostderr = 1;
#ifndef GFLAGS_GFLAGS_H_
namespace gflags = google;
#endif
gflags::SetUsageMessage("Convert a set of images to the leveldb/lmdb\n"
"format used as input for Caffe.\n"
"Usage:\n"
" convert_imageset [FLAGS] ROOTFOLDER/ LISTFILE DB_NAME\n"
"The ImageNet dataset for the training demo is at\n"
" http://www.image-net.org/download-images\n");
gflags::ParseCommandLineFlags(&argc, &argv, true);
if (argc < 4) {
gflags::ShowUsageWithFlagsRestrict(argv[0], "tools/convert_imageset");
return 1;
}
上面这部分源码就是在解析参数,主要是在使用gflags进行操作,在最开始通过宏的方式定义了几个全局参数,这些参数都会在命令行或者脚本传入参数的时候被赋值,这些变量都会被加上前缀FLAGS_,下面是一段工具使用时的命令参数,来感受一下:
GLOG_logtostderr=1 $TOOLS/convert_imageset \
--resize_height=$RESIZE_HEIGHT \
--resize_width=$RESIZE_WIDTH \
--shuffle \
$TRAIN_DATA_ROOT \
$DATA/train.txt \
$EXAMPLE/ilsvrc12_train_lmdb
gflags就是这样通过脚本或者命令行给相应变量赋值的工具,进入主函数之后的代码也是在做解析命令。我们继续往下读:
const bool is_color = !FLAGS_gray;
const bool check_size = FLAGS_check_size;
const bool encoded = FLAGS_encoded;
const string encode_type = FLAGS_encode_type;
std::ifstream infile(argv[2]);
std::vector<std::pair<std::string, int> > lines;
std::string filename;
int label;
while (infile >> filename >> label) {
lines.push_back(std::make_pair(filename, label));
}
好了,这里我们就来好好分析几个参数:
gray 用来标识输入的是否是灰度图像
check_size 用来标识是否检查数据
encoded 用来标识编码,而encoder_type则用来标识编码的类型,好像默认是jpg,如果你的图像是其它格式,你需要对这个参数进行修改。
shuffele 用来标识是否被洗牌(序列随机化)
backend 用来标识数据类型,默认为lmdb
resize参数 用来自动将图像进行缩放,缩放至同样大小,因为caffe接收的图像一定是同样大小的(如果你没有修改caffe源码的话)
在上面那段代码最后的while循环,就是在取出图像的名字和标签,这也是这个工具不支持多标签的原因,你可以从这里开始修改源码,让这个工具来支持多标签(你还需要修改caffe的源码,这部分内容请点击菜单栏的caffe笔记,我把资料整理在那里)
if (FLAGS_shuffle) {
// randomly shuffle data
LOG(INFO) << "Shuffling data";
shuffle(lines.begin(), lines.end());
}
LOG(INFO) << "A total of " << lines.size() << " images.";
if (encode_type.size() && !encoded)
LOG(INFO) << "encode_type specified, assuming encoded=true.";
int resize_height = std::max<int>(0, FLAGS_resize_height);
int resize_width = std::max<int>(0, FLAGS_resize_width);
上面这段源码也就比较好懂了,根据输入参数做相应的洗牌操作等。
// Create new DB
scoped_ptr<db::DB> db(db::GetDB(FLAGS_backend));
db->Open(argv[3], db::NEW);
scoped_ptr<db::Transaction> txn(db->NewTransaction());
// Storing to db
std::string root_folder(argv[1]);
Datum datum;
int count = 0;
int data_size = 0;
bool data_size_initialized = false;
for (int line_id = 0; line_id < lines.size(); ++line_id) {
bool status;
std::string enc = encode_type;
if (encoded && !enc.size()) {
// Guess the encoding type from the file name
string fn = lines[line_id].first;
size_t p = fn.rfind('.');
if ( p == fn.npos )
LOG(WARNING) << "Failed to guess the encoding of '" << fn << "'";
enc = fn.substr(p);
std::transform(enc.begin(), enc.end(), enc.begin(), ::tolower);
}
status = ReadImageToDatum(root_folder + lines[line_id].first,
lines[line_id].second, resize_height, resize_width, is_color,
enc, &datum);
if (status == false) continue;
if (check_size) {
if (!data_size_initialized) {
data_size = datum.channels() * datum.height() * datum.width();
data_size_initialized = true;
} else {
const std::string& data = datum.data();
CHECK_EQ(data.size(), data_size) << "Incorrect data field size "
<< data.size();
}
}
// sequential
string key_str = caffe::format_int(line_id, 8) + "_" + lines[line_id].first;
// Put in db
string out;
CHECK(datum.SerializeToString(&out));
txn->Put(key_str, out);
if (++count % 1000 == 0) {
// Commit db
txn->Commit();
txn.reset(db->NewTransaction());
LOG(INFO) << "Processed " << count << " files.";
}
}
根据要存储的类型创建相应的数据库(lmdb或者leveldb),这里的核心就是这个最外面的大for循环了,这里根据文件名读取图像并缩放到同样大小,根据需要检查数据,然后将其写入数据库,每1000副图像一个Transaction,而最后一批次可能不到1000,在for循环外有:
// write the last batch
if (count % 1000 != 0) {
txn->Commit();
LOG(INFO) << "Processed " << count << " files.";
}
这样我们就明白这个工具的工作流程了。
See You Next Chapter!
您好,我怎么没有找到左侧的caffe笔记(关于源码的修改)???
抱歉,网站改版过一次,现在在最上面的菜单栏了