caffe提供了将图像转换为lmdb或者leveldb格式的工具,在tool文件夹下的convert_imageset中可以找到对应文件,这个工具在很多例子中都有用到,比如mnist和imagenet,由于caffe默认使用lmdb这种又快又小的格式,我们在处理大量图像时也会用到,而我们如果要根据自身需求进行修改,那就需要读源码了。
这里忍不住扯一些别的,convert_imageset工具不支持浮点数和多标签,而博主的label都是浮点数和多标签,前两天准备全部使用hdf5来存储data和label,后来发现图片存储成hdf5是一件耗时费力占空间的事,于是考虑将标签存储为hdf5,而对UINT8类型的图像使用lmdb进行存储,要存成lmdb自然就会想到使用自带的工具,于是就来分析这个工具了。
我们从convert_imageset第一行开始,细细的读:
#include <algorithm> #include <fstream> // NOLINT(readability/streams) #include <string> #include <utility> #include <vector> #include "boost/scoped_ptr.hpp" #include "gflags/gflags.h" #include "glog/logging.h" #include "caffe/proto/caffe.pb.h" #include "caffe/util/db.hpp" #include "caffe/util/format.hpp" #include "caffe/util/io.hpp" #include "caffe/util/rng.hpp" using namespace caffe; // NOLINT(build/namespaces) using std::pair; using boost::scoped_ptr;
上面是文件的声明部分,caffe的工具和caffe一样穿插着glog、gflags等等库,不得不承认google的库确实非常好用,在读caffe源码前请务必了解这几个库,顺带加上protobuf:
DEFINE_bool(gray, false, "When this option is on, treat images as grayscale ones"); DEFINE_bool(shuffle, false, "Randomly shuffle the order of images and their labels"); DEFINE_string(backend, "lmdb", "The backend {lmdb, leveldb} for storing the result"); DEFINE_int32(resize_width, 0, "Width images are resized to"); DEFINE_int32(resize_height, 0, "Height images are resized to"); DEFINE_bool(check_size, false, "When this option is on, check that all the datum have the same size"); DEFINE_bool(encoded, false, "When this option is on, the encoded image will be save in datum"); DEFINE_string(encode_type, "", "Optional: What type should we encode the image as ('png','jpg',...)."); int main(int argc, char** argv) { #ifdef USE_OPENCV ::google::InitGoogleLogging(argv[0]); // Print output to stderr (while still logging) FLAGS_alsologtostderr = 1; #ifndef GFLAGS_GFLAGS_H_ namespace gflags = google; #endif gflags::SetUsageMessage("Convert a set of images to the leveldb/lmdb\n" "format used as input for Caffe.\n" "Usage:\n" " convert_imageset [FLAGS] ROOTFOLDER/ LISTFILE DB_NAME\n" "The ImageNet dataset for the training demo is at\n" " http://www.image-net.org/download-images\n"); gflags::ParseCommandLineFlags(&argc, &argv, true); if (argc < 4) { gflags::ShowUsageWithFlagsRestrict(argv[0], "tools/convert_imageset"); return 1; }
上面这部分源码就是在解析参数,主要是在使用gflags进行操作,在最开始通过宏的方式定义了几个全局参数,这些参数都会在命令行或者脚本传入参数的时候被赋值,这些变量都会被加上前缀FLAGS_,下面是一段工具使用时的命令参数,来感受一下:
GLOG_logtostderr=1 $TOOLS/convert_imageset \ --resize_height=$RESIZE_HEIGHT \ --resize_width=$RESIZE_WIDTH \ --shuffle \ $TRAIN_DATA_ROOT \ $DATA/train.txt \ $EXAMPLE/ilsvrc12_train_lmdb
gflags就是这样通过脚本或者命令行给相应变量赋值的工具,进入主函数之后的代码也是在做解析命令。我们继续往下读:
const bool is_color = !FLAGS_gray; const bool check_size = FLAGS_check_size; const bool encoded = FLAGS_encoded; const string encode_type = FLAGS_encode_type; std::ifstream infile(argv[2]); std::vector<std::pair<std::string, int> > lines; std::string filename; int label; while (infile >> filename >> label) { lines.push_back(std::make_pair(filename, label)); }
好了,这里我们就来好好分析几个参数:
gray 用来标识输入的是否是灰度图像
check_size 用来标识是否检查数据
encoded 用来标识编码,而encoder_type则用来标识编码的类型,好像默认是jpg,如果你的图像是其它格式,你需要对这个参数进行修改。
shuffele 用来标识是否被洗牌(序列随机化)
backend 用来标识数据类型,默认为lmdb
resize参数 用来自动将图像进行缩放,缩放至同样大小,因为caffe接收的图像一定是同样大小的(如果你没有修改caffe源码的话)
在上面那段代码最后的while循环,就是在取出图像的名字和标签,这也是这个工具不支持多标签的原因,你可以从这里开始修改源码,让这个工具来支持多标签(你还需要修改caffe的源码,这部分内容请点击菜单栏的caffe笔记,我把资料整理在那里)
if (FLAGS_shuffle) { // randomly shuffle data LOG(INFO) << "Shuffling data"; shuffle(lines.begin(), lines.end()); } LOG(INFO) << "A total of " << lines.size() << " images."; if (encode_type.size() && !encoded) LOG(INFO) << "encode_type specified, assuming encoded=true."; int resize_height = std::max<int>(0, FLAGS_resize_height); int resize_width = std::max<int>(0, FLAGS_resize_width);
上面这段源码也就比较好懂了,根据输入参数做相应的洗牌操作等。
// Create new DB scoped_ptr<db::DB> db(db::GetDB(FLAGS_backend)); db->Open(argv[3], db::NEW); scoped_ptr<db::Transaction> txn(db->NewTransaction()); // Storing to db std::string root_folder(argv[1]); Datum datum; int count = 0; int data_size = 0; bool data_size_initialized = false; for (int line_id = 0; line_id < lines.size(); ++line_id) { bool status; std::string enc = encode_type; if (encoded && !enc.size()) { // Guess the encoding type from the file name string fn = lines[line_id].first; size_t p = fn.rfind('.'); if ( p == fn.npos ) LOG(WARNING) << "Failed to guess the encoding of '" << fn << "'"; enc = fn.substr(p); std::transform(enc.begin(), enc.end(), enc.begin(), ::tolower); } status = ReadImageToDatum(root_folder + lines[line_id].first, lines[line_id].second, resize_height, resize_width, is_color, enc, &datum); if (status == false) continue; if (check_size) { if (!data_size_initialized) { data_size = datum.channels() * datum.height() * datum.width(); data_size_initialized = true; } else { const std::string& data = datum.data(); CHECK_EQ(data.size(), data_size) << "Incorrect data field size " << data.size(); } } // sequential string key_str = caffe::format_int(line_id, 8) + "_" + lines[line_id].first; // Put in db string out; CHECK(datum.SerializeToString(&out)); txn->Put(key_str, out); if (++count % 1000 == 0) { // Commit db txn->Commit(); txn.reset(db->NewTransaction()); LOG(INFO) << "Processed " << count << " files."; } }
根据要存储的类型创建相应的数据库(lmdb或者leveldb),这里的核心就是这个最外面的大for循环了,这里根据文件名读取图像并缩放到同样大小,根据需要检查数据,然后将其写入数据库,每1000副图像一个Transaction,而最后一批次可能不到1000,在for循环外有:
// write the last batch if (count % 1000 != 0) { txn->Commit(); LOG(INFO) << "Processed " << count << " files."; }
这样我们就明白这个工具的工作流程了。
See You Next Chapter!
您好,我怎么没有找到左侧的caffe笔记(关于源码的修改)???
抱歉,网站改版过一次,现在在最上面的菜单栏了